Mersin Üniversitesi Kimya Mühendisliği Bölümü Yükseköğretim Kurumu Yürütme Kurulu'nun 14/02/1994 tarihli toplantısında alınan 94.5.342 sayılı karar ile öğrencisiz bölüm olarak kurulmuştur. Yükseköğretim Genel Kurulu’nun 20/03/2008 tarihli toplantısında 2547 Sayılı Kanun’un 2880 Sayılı Kanun’la değişik 7/h maddesi uyarınca 2008-2009 Eğitim-Öğretim yılından itibaren Kimya Mühendisliği Bölümü’ne lisans öğrencisi alınması uygun bulunmuştur.

Mersin Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Kimya Mühendisliği Anabilim Dalı 27/05/2002 tarihinde açılmış olup, 2002-2003 Eğitim-Öğretim döneminde Yüksek Lisans eğitimine, 2013-2014 Eğitim-Öğretim döneminde ise Doktora eğitimine başlamıştır. Halen 5'i doktora öğrencisi olmak üzere toplam& 46 lisansüstü öğrenci bölümümüzde öğrenim görmektedir.

Kimya Mühendisliği Bölümü, Mersin Üniversitesi Çiftlikköy Kampüsü Mühendislik Fakültesi F Blok'ta yer almaktadır.